Câu chuyện trong Thần Mộ xoay quanh Thần Nam, một chàng trai được hồi sinh sau một vạn năm tại Thần Ma Lăng Viên, nơi an táng những nhân vật hùng mạnh nhất trong lịch sử vũ trụ. Tọa lạc ở trung tâm Thiên Nguyên đại lục, khu vực này được chia thành nhiều cấp độ, với những ngôi mộ của thần linh và yêu ma cổ xưa. Khi tỉnh dậy, Thần Nam bắt đầu hành trình khám phá nguồn gốc của sự xuất hiện của mình tại đây và tìm kiếm Vũ Hinh, người con gái mà anh yêu thương.