MARS RED diễn ra vào năm 1923, thời điểm mà số lượng ma cà rồng gia tăng một cách đáng ngạc nhiên. Sự xuất hiện của một nguồn máu bí ẩn mang tên Ascra đã khiến tình hình trở nên căng thẳng hơn. Để đối phó với mối đe dọa này, chính phủ Nhật Bản đã thành lập Code Zero, một đơn vị quân đội đặc biệt có nhiệm vụ tiêu diệt ma cà rồng.
Dưới sự chỉ huy của Trung tướng Nakajima, Code Zero ban đầu là một đơn vị tình báo trong thời kỳ Thế chiến, nhưng giờ đây đã được chuyển giao để ứng phó với cuộc khủng hoảng “bùng nổ dân số” ma cà rồng. Những cuộc chiến cam go đang diễn ra, tạo nên một bối cảnh đầy kịch tính và hấp dẫn.